これまで、エリザベスの父親に関してレディントンが語ってきたことは、外国の情報収集が仕事であり、KGB局員カタリーナ・ロストヴァの夫で、火事の夜に亡くなったということだった。やがてエリザベスは、火事の夜、当時4歳の自分が父親に銃口を向け発砲したことを思い出す。一方、レディントンに雇われていた潜入工作員でエリザベスの夫トム・キーンは、彼女に父親は「生きている」と告げる。レディントンがもしかしたら父親かもしれないと疑いつつ、エリザベスは自分の過去、そして母親のことを探り始めるのだった。
そんな中、エリザベスに「自分こそおまえの父親だ」と告げるアレグザンダー・カークが登場。国際的犯罪者で敵とみなしていた男による衝撃の告白にエリザベスは大きなショックを受けるが、カークは本当にエリザベスの父親なのか？レディントンは、カークとエリザベス、そしてエリザベスの母親だとされるカタリーナ・ロストヴァとはどういう関係にあった人物なのか？これまで、レディントンはエリザベスの父親ではないかという疑問が何度となく浮上してきたが、シーズン4ではエリザベスの父親をめぐる謎がついに解き明かされる……！？

カタリーナ・ロストヴァがモスクワで生んだ娘“マーシャ・ロストヴァ”の存在はほとんど知られていなかったのだが、“結社”がその名前を公にしたことで、エリザベスは何者かに執拗に追われることになる。その正体はエリザベスの父親だと名乗るアレグザンダー・カークだった。レディントンはなぜ、エリザベスを“父親”から守ろうとするのか。レディントンがいまだ語らない真実が存在するのであれば、エリザベスは一体何者なのか。
自分の意に反してアレグザンダー・カークによって連れ去られたエリザベスではあるが、カークと接することによって子供時代の記憶が蘇り、エリザベスは謎の存在である母親のことも思い出していく。ありとあらゆる手段を尽くしてまで自分とアグネスを傍におこうとするカーク。自分の父親がカークであるならば、父親でもないレディントンがカーク以上に自分を守ることにこだわるのはどうしてなのか？カークとレディントンをそこまで固執させる自分の存在とは一体何なのか。「ブラックリスト」のファンたちは、エリザベスと共に彼女の秘められた正体に迫ることになるのである。

FBI勤務初日に犯罪者レディントンに指名されて以来、人生が激変したエリザベス。そんな彼女にレディントンは、「理由は父親だ」とだけ伝え、時に父親のように接し、自分の身を顧みず助けてきた。火事の夜、当時4歳のエリザベスを親友であるサムに託し、潜入工作員トム・キーンを雇ってエリザベスを監視させ、その行動を見守ってきた。すべてはエリザベスを守るための行動だと断言するレディントンだが、彼女の父親でないのであれば、エリザベスを守る理由は一体何なのか？
一方、犯罪とは無縁の安全な世界で娘アグネスを育てたいと願うエリザベスは、レディントンの手の及ばないところに逃げようとする。さらに父親だと名乗るアレグザンダー・カークからは、レディントンこそが父娘の仲を引き裂いた張本人だと聞かされる。度重なる危機を共に乗り越えていくうちに信頼関係と絆が芽生え、一時はレディントンが自分の父親ではないかと考えていたエリザベスだったが、アレグザンダー・カークの登場により、エリザベスは自分の過去と向き合い、真実をつかむことを心に決める。
レディントンは、これまでと同じようにエリザベスを守ろうとはするものの、彼女が死を偽装してまで自分から逃れようとしたことは重く受け止めているようで……。2人の関係は新たな局面を迎えることになる。

優れたドラマには、カリスマ性のある主役と共に忘れられない印象を残す個性的な脇役が欠かせないが、「ブラックリスト」も例外ではない。そんな脇役の1人がミスター・キャプランことケイト・キャプラン。デンベと共にレディントンの片腕的存在で、レディントンにとって都合が悪い犯罪現場の痕跡を完全に消滅させる“掃除屋”の役目を果たすのが常のキャプランだが、レディントンとの付き合いは一番長く、エリザベスの過去にも関わってきたことが示唆されている。おそらくレディントンが最も信頼を寄せていたキャプランが、エリザベスのためを思ってのことだったとはいえ、レディントンを騙してエリザベスの死の偽装工作に助力する。そんなキャプランをレディントンは果たして許すことができるのか？「ブラックリスト」のクリエイター、ジョン・ボーケンキャンプは、キャプランの運命について以下のようにコメントしている。「レッドの眼にはキャプランは自分を裏切ったとしか映らない。彼が裏切り者に対してどのような行動を取るかということについては、過去の例を見ればわかるから、キャプランにとっては良い方向には進まない。レッドとキャプランの関係は非常に難しい状況を迎えることになるんだ。」

エリザベスが娘アグネスを無事出産しながらも、出産直後に死んだというニュースが報じられた際は、エリザベスが様々な事件を共に解決してきた仲間であるFBIのメンバーたち、クーパー、レスラー、アラム、ナヴァービはエリザベスの死を深く悲しんだ。それだけに、エリザベスの死はレディントンから離れるための偽装工作で実は生きているというニュースを聞いた時は、嬉しさと憤りが混じった複雑な気持ちにならざるをえない。中でもナヴァービはエリザベスに欺かれたことが許せず、誘拐されたエリザベスたちを救助するためにキューバに急行するよう指示するクーパーの命令を拒否。やむなくレスラーが単独でキューバに向かうことになる。ナヴァービ同様、エリザベスの行為で傷つけられたと感じたアラムはナヴァービの態度を軟化させようと試みるが、ナヴァービは頑なにエリザベスへの助力を拒む。それまで、レディントンの協力のもと、数々の国際的な犯罪者たちを追跡、逮捕してきたFBIチームだったが、エリザベスの偽りの死から生まれたわだかまりはやがて消えていくのか。しばらくの間は見るものをヤキモキさせそうである。

2016年4月、人気のキャラクター、トム･キーンを主人公にしたスピンオフ･シリーズの制作が決まり、そのパイロット版としてシーズン3第22話「アレグザンダー･カーク（前編）」がオンエアされた。
スコティーことスーザン・ハーグレイヴ（ファムケ・ヤンセン）率いる“ハルシオン・イージス”は表向きは警備会社だが、傭兵や犯罪者、凄腕の工作員に最新鋭のテクノロジーをそろえ、政府機関が表立って動けない案件など、どんな仕事も金額次第で請け負う特殊部隊。“結社”と決別したソロモンを雇い、エリザベス誘拐を計画したのも、アレグザンダー･カークから依頼を受けた“ハルシオン”だった。レディントンは、アレグザンダー･カークの居場所を探るため、スコティーと手を組み、トム･キーンは“ハルシオン”のメンバーと共にある計画に参加することになる。
このエピソードの評判は期待通りのもので、NBCはスピンオフ･シリーズの製作を正式決定。2017年に全米での放送が控えている「The Blacklist: Redemption（原題）」にはトム･キーン役ライアン･エッゴールドと、スコティー役ファムケ･ヤンセン（『X-MEN』シリーズ）に加え、ソロモン役のエディ・ガテギ（『トワイライト』『X-MEN： ファースト・ジェネレーション』）、タウニー・サイプレス（「HEROES／ヒーローズ」）らの出演が決まっている。レディントンとエリザベスの“父親問題”と同じように、「The Blacklist: Redemption（原題）」では、孤児として育ったトム･キーンと、彼の母親であるらしいスコティーの“母親問題”も絡めて描かれていくという。「ブラックリスト」とも密接に関わっていくことになるだろう、「The Blacklist: Redemption(原題)」のヒットも間違いなしだ。